基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立

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简介:为实现家畜寄生虫卵识别的数字化和自动化,选取了家畜常见16种蠕虫卵进行图像采集和特征分析,将整合的图片与信息进行绑定,利用Access 2003初步建立了16种蠕虫卵的原始图像库。该图像库简单实用,易于操作,共包含1 823幅原始图像,基本涵盖了每种虫卵图像的多种表现形式。通过Access 2003建立的寄生虫卵图像库,不仅可以快速储存查询虫卵图像信息,为之后的虫卵图像自动识别奠定了良好的基础。

摘 要: 为实现家畜寄生虫卵识别的数字化和自动化,选取了家畜常见16种蠕虫卵进行图像采集和特征分析,将整合的图片与信息进行绑定,利用Access 2003初步建立了16种蠕虫卵的原始图像库。该图像库简单实用,易于操作,共包含1 823幅原始图像,基本涵盖了每种虫卵图像的多种表现形式。通过Access 2003建立的寄生虫卵图像库,不仅可以快速储存查询虫卵图像信息,还可以进行资源网络共享,为之后的虫卵图像自动识别奠定了良好的基础。

0 引言

现阶段,寄生虫病仍严重影响家畜健康。寄生虫种类繁多,不同类的寄生虫卵形态特征和大小也可能极为相似,如肝片吸虫卵与前后盘吸虫卵,胰阔盘吸虫卵与中华双腔吸虫卵。对于这些形态相似的虫卵,人们用肉眼很难准确判别。而且虫卵本身在不同时期也会呈现不同形态,有的甚至相差很大,对于不太成熟的虫卵,卵内容物充满整个卵壳,与成熟卵有很明显的差异。虫卵的这些特点导致准确判别难度较大,传统的检验方法不仅要求技术人员有较高的水平,而且观察到的虫卵图像也不方便存储,阻碍了寄生虫学的研究与发展。

Access 2003是微软公司Office系列应用软件之一,操作简单,无需编程,人机交互界面友好,还能与Office系列其他办公软件Excel、Word等实现数据交换,现已广泛应用于多个领域的研究中[1-8]。本文利用Access 2003建立了16种家畜常见蠕虫卵的原始图像库,共1 823张虫卵图像,并实现了网络数据共享,为虫卵识别系统的研究提供了基本数据来源。

1 材料与方法

1.1 系统软件

操作系统:Windows XP Professional。应用软件:Microsoft Office 2003。

1.2 图像来源与采集

在显微镜下,选取轮廓清晰的虫卵,借助于Moticam Pro 282A图像采集系统,在10×10倍数下进行拍照,每幅图像像素设定为1 360×1 024。将已经成功收集的虫卵图像用Motic Image Advanced 3.2软件测量每种虫卵的长径和宽径,然后进行数据分析。借助Photoshop 9.0应用软件将原始图像人工分割成单个虫卵图像,去除背景杂质后逐一存储,建立16种蠕虫卵的原始图像库,共1 823张。虫卵原始图像主要分为4类:吸虫、线虫、绦虫和球虫。其中吸虫包括:肝片吸虫48张、中华双腔吸虫60张、胰阔盘吸虫85张、前后盘吸虫71张;线虫包括:马歇尔线虫15张、细颈线虫78张、夏伯特线虫199张、仰口线虫190张、捻转血矛线虫530张、毛圆线虫28张、食道口线虫131张、奥斯特线虫220张、毛尾线虫83张;绦虫包括:莫尼茨绦虫38张、曲子宫绦虫3张;球虫仅有一类,44张。

2 图像库的构建

2.1创建新的图像库

启用Access 2003新建一个空的数据库,取名为“虫卵图像库”。

2.2 字段的设计

根据寄生虫虫卵特点设计出8项相关字段,依次为:虫卵名称、虫卵大小、虫卵特征、虫体特征、寄生部位、虫卵图片、放大倍数、分辨率。为方便检索和防止数据重复输入,把虫卵名称设置为主键。

2.3 创建图像库表

数据库的原始图像及信息存储在表中,它是整个数据库的基础和核心。选择设计器创建新表,逐项添加所需的字段名和数据类型,并设置字段大小、索引等项目,以“虫卵大小(um)”这一项为例,“数据类型”这一项选择“文本”,“字段大小”设置为“255”,“必填字段”设置为“是”,“允许空字符串”设置为“否”,将“索引”设置为“有(有重复)”。需要注意的是,“虫卵图像”这一项“数据类型”应设置为“OLE对象”。此图像库以虫卵名称对表进行命名,例如奥斯特线虫表,该图像库共创建16个表。

在已经完成的表中,定位插入点即可输入相应的信息。在对“虫卵图像”单元格的操作中,需要注意,定位插入点后,在菜单栏中点击“插入”对象选项,弹出的“Microsoft Office Access”窗口中,选择“由文件创建”后点击“浏览”,在弹出的浏览窗口中选择该类虫卵图像所在的文件夹,选中第一幅图像,单击“确定”按钮,返回到“Microsoft Office Access”窗口,再勾选上“链接”选框。这样就将虫卵图像与Access动态链接起来。当有新的虫卵图像录入时,仅将新图像存入到该文件夹即可,方便了图像库的更新。

2.4 创建数据库窗体

窗体是Access数据库的重要组成部分,利用它可以使数据库的输入、更新和查看变得直观简洁。使用窗体向导创建窗体,在打开的窗体向导对话框中,在“表/查询”下拉列表框中选择以虫卵名称命名的表,将表内所有字段添加到窗体中,以虫卵名称命名窗体,如“奥斯特线虫”窗体,该图像库共创建16个窗体。建成后的窗体如图1所示。

基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立

在已创建的数据库中还需创建一个主窗体,将各个窗体进行分类链接,方便用户查找使用。使用设计视图创建窗体,在已打开的界面中,使用工具箱添加标签和命令控件,通过更改属性,将标签名称设置为虫卵名称,在打开的命令按钮向导对话框中,在“类别”选项中选择“打开窗体”操作。设计完成的主窗体界面如图2所示。

基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立

3 结果分析

3.1 16种虫卵的形态特征

虫卵识别系统一般流程为:输入待识别图像→对图像进行预处理与分割→特征参数提取→识别分类→输出结果。其中特征提取是最重要的一步,一般特征提取取决于虫卵的形状、大小、内含物、颜色和特殊结构(卵壳厚薄、特异形态)。借助于分割出的虫卵图像,通过查阅资料和细致观察,本文总结了16种虫卵的形态特征。

3.1.1 吸虫类

肝片吸虫:呈椭圆形,黄褐或淡黄色,卵盖不明显,卵壳薄而光滑,半透明,分两层,充满卵细胞和一个胚细胞,长径为120~150基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为70~80基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

中华双腔吸虫:呈不对称的卵圆形,少数为椭圆形,暗褐色,一端有稍倾斜的卵盖,壳口边缘有齿状缺刻,内含毛蚴,长径为38~45基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为22~30基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

胰阔盘吸虫:呈椭圆形,黄棕或深褐色,两侧不对称,一端有卵盖,卵壳厚,内含毛蚴,卵内有已发育的毛蚴,长径为41~52基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为30~34基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

前后盘吸虫:呈椭圆形,淡灰色,卵细胞不充满,一端较拥挤,钝端有卵盖,长径为114~176基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为73~100基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

3.1.2 线虫类

马歇尔线虫:虫卵很大,与细颈属的一样同为圆线虫类虫卵中最大者,卵细胞色淡,较密集,长径为182~217基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为83~115基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

细颈线虫:虫卵大,卵内细胞色黑、较大,长径为165~175基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为76~86基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

夏伯特线虫:卵壳较厚,卵细胞较大,排列整齐,色深,长径为85~132 ?滋m,宽径为42~56基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

仰口线虫:略似长方形,两端钝圆,两侧平行,卵细胞大而深(8~16个胚细胞),长径为79~97基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为47~50基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

捻转血矛线虫:呈椭圆形,卵壳薄,卵细胞16~32个,淡灰色,比较充满,长径为75~95基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为40~50基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

毛圆线虫:呈长卵圆形,一端钝一端尖,两侧不对称,卵细胞色淡而且多,长径为76~92基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为37~46基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

食道口线虫:呈椭圆形,卵细胞界限较明显,一端有空隙,长径为73~89基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为34~45基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

奥斯特线虫:类似圆形,卵细胞集中于一端,空隙较大,长径为62~82基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为34~42基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

毛尾线虫:虫卵腰鼓形,黄褐色,两端具塞,长径为70~80基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为30~40基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

3.1.3 绦虫类

莫尼茨绦虫:虫卵呈三角形、四边形或圆形,内有一个含六钩蚴的梨形器,虫卵大小为50~60基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

曲子宫绦虫:卵近圆形,无梨形器,每3~8个卵细胞有一个子宫周围器包囊着,虫卵直径为18~27基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

3.1.4 球虫

球虫:呈椭圆形、圆形或球形,无色、淡黄色或淡绿色,长径为22~41基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m,宽径为16~36基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立m。

对于上述16种虫卵,每类虫卵均选择了一张图像,如图3所示。

基于Access的家畜寄生虫卵图像库的建立

3.2 数据库的特点及功能

3.2.1 快速、准确地录入资料

在建立数据库之前,认真分析虫卵特点,设计出能充分、全面反映虫卵特点的字段。选取虫卵名称为关键字,防止资料的重复输入。由于字段拥有说明和自动更正功能,可以保证资料输入的可靠性。

3.2.2 输入输出功能

利用窗体可以建立直观简洁的交互界面。通过Access与其他Office软件进行文件相互转换,可以满足各种类型的资料显示与输出。

3.2.3 网络共享功能

利用Access建立网页,将图像库与其他虫卵研究单位进行资源共享,实现多中心、大样本的虫卵图像库。基础兽医教育者可在网页上进行虫卵图像的下载,应用在多媒体教学上,提高具有时代特色的教学水平。

4 结论

目前,国内外学者已积极展开寄生虫卵自动识别系统的研究,但受研究对象的局限,种类少,距离解决实际问题相差甚远。纵然识别方法层出不穷,但由于所使用的图像库不同,并不能纵向比较各种识别方法的优劣。寄生虫卵原始图像不易获取,很多计算机方面的技术人才鉴于原材料的限制,无法对虫卵识别系统展开研究。随着数据库管理系统的建立和发展,建立寄生虫虫卵原始图像库显得尤为重要,将零散的虫卵图像入库,再经过网络共享,形成完善、庞大的图像库,将极大地推动虫卵识别系统的研究。Access数据库操作简单,无需编程,对没有汇编语言基础的工作者来说,也能很方便使用。此外,完善的图像库还可直接应用在课堂中,活跃课堂气氛,提高教学质量。

参考文献

[1] 钟洪才,方驰华,巨邦律,等.Access原发性肝癌数据库的建立及其应用价值初探[J].第四军医大学学报,2004,25(21):2011-2013.

[2] 余江,卿三华,黄祥成,等.大肠癌Access数据库的建立及其应用[J].第一军医大学学报,2003,23(1):78-79.

[3] 巨邦律,方驰华,钟洪才,等.肝内胆管结石Access数据库的建立及其应用[J].第四军医大学学报,2005,26(5):428-430.

[4] 魏强,邓文锋,叶俊生.肾移植患者Access数据库的建立和应用探讨[J].中国现代医学杂志,2009,19(11):1756-1760.

[5] 靳彩彩,李芳.运用Access 2003软件建立“药品信息查询系统”数据库[J].中国药房,2010,20(13):1247-1248.

[6] 陈荣,夏宗玲,袁赟.治疗药物监测Access数据库的建立及应用[J].中国药房,2010,21(10):948-950.

[7] 蔡珠华,何援利,钟洪才,等.子宫内膜异位症Access数据库的建立及其应用价值探讨[J].生殖与避孕,2005,8(25):483-485.

[8] 刘扬.基于Access数据库的辅助电极管理信息系统[J].微型机与应用,2014,33(5):11-15.

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