Windows CE 是一个具有先占式多任务功能，并具有强大通信能力的嵌入式操作系统。Windows CE 是微软专门为信息设备、行动应用、消费类电子产品、嵌入式应用等非PC 领域而全新设计的策略性操作系统产品。本节选择几种应用程序领域，介绍Windows CE 的应用情况。
1)PDA 市场
微软希望PC 消费者普遍使用安装Windows CE 操作系统的PDA。但Windows CE 1.0版不支持手写识别，使用者必须靠键盘输入，操作非常麻烦。2.0 版则对硬件要求很高，增加了使用者的成本。因此，在与Palm 的初期较量中，微软并不占上风。
2000 年，微软对使用Windows CE 3.0 以后版本的设备进行了区分，针对PDA 类的操作系统更名为Pocket PC。微软通过加强与各大硬件厂商的合作逐步进攻Palm 操作系统及其终端产品的市场。截至2001 年，微软已经占有PDA 操作系统30%的市场占有率。
目前，在 PDA 市场中，已基本形成了微软与Palm 对垒的局面。Palm 阵营的产品致命的弱点是系统开放性差、应用程序有限、功能延展空间小；而微软阵营的产品因Windows CE 操作系统开放性好、应用程序开发厂商众多、功能强大，而且与PC、甚至Internet 的互动性强等优点，逐步占据了上风。
2)新一代手机操作系统
无线通信市场是一个巨大的市场。早在 1999 年7 月，比尔·盖茨就曾试图与行动通信巨头诺基亚建立合作关系，但双方的谈判未能取得任何结果。相反，诺基亚与其它无线通信领域巨头闪电般地建立了Symbian 联盟。但微软并未因此放弃。
微软公司一直从事着一个代号为“Stinger”智能电话开发计划的研究，将最好的PDA和最好的电话组合在一起，构建一个使用者能够随时随地保持智能性连接，通过语音、电子邮件或其它途径的平台。Microsoft 智能电话平台向使用者提供不断更新的个人信息、电子邮件以及强大的Web 浏览功能。该平台包含支持HTML、WAP（WML）和XML 格式的Web 浏览器。
微软在 2002 年推出了Pocket PC 2002 软件平台，专门针对行动商务专业人士以及企业用户设计，强化了商务与沟通的功能，内建全中文化的Pocket Outlook 等文字与图像处理软件，让中文用户能够通过网络及时获取企业内部信息，进行档案处理、企业简报以及共享数字影音信息。Phone Edition 建立在Pocket PC 2002 的基础之上，添加了数据和语音通信功能，在提供行动电话功能（包括语音通信和SMS 文字消息）的同时，还增加了诸如Email、Web 浏览和实时消息等迅速和容易的数据连接功能。
2002 年微软推出了Smartphone 2002。Smartphone 2002 是微软开发的新一代手机操作系统平台，这一智能电话解决方案把平台整合提升到一个新的层次，为手机使用者提供了语音、数据及多媒体功能，如：行动电子邮件和个人信息、强大的网页浏览功能、音讯视讯播放和分流以及丰富的游戏等等。由于使用彩色屏幕，使用者可以藉由无线网络下载各种丰富的图形、动画及游戏。Smartphone 2002 软件通过与微软的后端服务器及服务相结合，成为行动商务人士以及公司用户利用小型行动电话实现行动服务和因特网浏览的主要平台。
行动设备是一种个人工具。有些人认为它应以语音为中心，他们觉得一部电话即可满足需要。另一些人则希望获得PDA 所提供的数据处理能力。还有些人希望通过同一设备同时实现这两项功能，并要求这种设备应小到能够随身携带，同时又足以储存所需数据。比功能电话稍大、却又小于Pocket PC 的智能电话在同一设备中整合了语音及丰富的无线数据功能。智能电话首先是一部功能强大的电话，此外，它还为那些需要随时随地与重要时效性信息保持连接的使用者提供了大量在线和离线应用程序。
在无线网络上，当前存在着两种不同的观点。一种观点认为无线网络是现有因特网内容与服务的延伸，应该为使用者提供类似在PC 上使用因特网的行动终端和操作接口。而另一种观点则认为使用者需要更为个性化的信息与服务，根本不需要、也不可能将现有因特网上过于泛滥的信息搬到无线网络上，无线网络上的信息与服务应沿着类似短信的模式发展。从使用者的角度看，第一种观点更具想象空间，而第二种观点则有些保守。当前，无线网络的数据传输速度正在不断加快，当无线网络的数据传输速度达到每秒几十K 甚至更高的时候，使用者怎么还会满足于仅仅收发短信呢？
微软是第一种观点的坚定支持者，而手机巨头们的保守态度，是否意味着传统手机厂家们最终将丢失行动终端市场呢？！目前，采用微软Smartphone 2002 新一代手机操作系统平台的厂家逐渐增多，这些厂家基本上都是无线手机市场的后来者，他们正在和微软一起向传统手机的阵营发起了挑战。
3) 工业控制
Windows CE 在市场上被证明是工业控制领域的一种典型解决方案。它是把产品置于可靠软件和可靠硬件上的一个有效办法。Windows CE 为设计单位、制造厂家和客户带来了收益。它降低了产品生存周期中各个阶段的成本，并且缩短了自定解决方案所需的进入市场时间。