1、控制原理不同
通用变频器控制是采用通用变频器对受控的水泵电机、风机电机进行单独的控制。当其控制系统检测到某一受控量值时，就按这个量值与给定值之间的误差进行比例（P）、积分（1）和微分（D）之间的线性组合进行控制，即PID控制。这种控制方法只适合于线性系统中，并对单一控制对象实施控制。
动态变流量节能控制系统是采用模糊控制技术与变频技术相结合的控制原理，固然也使用了通用变频器（VVVF），但它不是采用PID控制方式，而是采用模糊控制方法。也就是在整个系统控制过程中，以语言描述人类知识，并把它表示成模糊规则或关系，通过推理、利用知识库，把某些知识与过程状态结合起来的控制行为。它并不具有明显的PID结构，但也可以称为非线性PID控制器，它是根据系统的误差信号和误差的微分或差分来决定控制器的参数，尤其适合非线性和时变性的被控对象。
2、控制方法的不同
中心空调系统的受控参数受季节变化、环境变化、使用时间、人流量等多种因素的综合影响，是一个随机变量，而不是一个线性系统，只是一个非线性系统。因此，决定中心空调系统冷冻（温）水流量和温度、冷却水流量和温度的需求量也是一个随机变量。
通用变频器所采用的最重要的控制参数，如比例系数K、积分时间常数T1和微分时间常数Td都是使用经验数据或试验数据确定的，一旦选定就不能自动调节。因此，PID控制系统只适合于线性系统，对于非线性系统不可能达到最佳控制，即选用比例系数和时间常数后，采用同一种控制方法对付各种不同的负荷状态，效果当然是不理想的。
模糊控制系统本来就不要求正确把握受控量的数值，但是它已经考虑了受控量的各种可能性，跟踪受控参数的变化，始终使被控系统处于最佳运行状态，对于各种非线性系统和时变性系统都能提供最佳的决策。
3、控制效果的不同
通用变频器用PID控制方法，控制非线性系统时，很轻易引起中心空调系统的强烈振荡，使控制范围在较大范围内波动，增加了系统的能耗，也很轻易使系统长时间都不能达到给定值的稳定状态，控制效果不理想，对于主机所配套的冷冻水泵和冷却水泵以及冷却塔风机等设备的节能最多在20%-30%之间。因其采取了保障冷水机组工作状态的措施，不可能节约燃料和主机电能。当然，也不能实现资源共享和无人值守治理。
而动态变流量节能控制系统由于建立了优化模糊控制模型，对于中心空调系统可能出现的题目都给出充分的估计，因此，在计算中存储的总决策表能提供最佳的控制方案，系统稳定性好，极少出现振荡现象，系统很快就能达到稳态。可采用正确调节流量的方法往实现节能，水泵以及冷却塔等均匀节能达60%-80%.由于采取了特殊措施保障中心空调主机的高转换效率，机组COP值始终处于最佳值，因此对于吸收式溴化锂机组可节约燃料20%-40%，对于电制冷主机可节电10%-30%.
动态变流量控制用具有强大的节能功能，在系统设计时就进行了系统集成，实现了各子系统的联动和互操纵，达到了资源的共享的目的。由于自动功能非常强大，从而实现了无人值守治理和联网治理等，节省了人力、物力。这些都是通用变频控制系统无法实现的。